有人认为输血后庚型肝炎的潜伏期平均为61日。已发现感染后病毒在体内可存在相当一段时间，已报道庚肝病毒核糖核酸(HGVRNA)可持续9年。急性庚型肝炎的血清丙氨酸 氨基转移酶(ALT，简称转氨酶)升高幅度不如乙型肝炎或丙型肝炎。一般临床症状较轻，出现显性黄疽者亦不如丙型肝炎多见，部分患者仅是无黄疽型加低水平转氨酶升高，甚至毫无自觉症状。对症处理后ALT多数在1月内恢复正常；由急性庚型肝炎自发转成慢性庚型肝炎者似较丙型肝炎少见，但病毒携带者并不少见。
庚肝病毒感染后临床上可能有8种转归：
(1)一过性的病毒血症，病毒很快被人体清除，称谓隐性感染。
(2)出现急性肝炎表现。单纯庚肝病毒感染的ALT增高程度及黄疽深度可能比急性丙型肝炎轻，但临床上常与丙型肝炎，甚至乙型肝炎合并感染，多数患者很快康复。
(3)病毒持续存在，部分患者始终处于低滴度状态，少部分血清里含有中到高滴度的HGV，但均无临床症状，为无症状病毒携带者。
(4)病情延迟，转氨酶随血中病毒滴度的波动而出现间隙性增高。
(5)少数病情迁延，反复发作成为慢性肝炎。
(6)可能引起暴发型肝炎。有限资料表明，以亚急性重型肝炎多见。
(7)庚型肝炎慢性感染到发生肝硬变需较长时间，但一旦发生肝硬变，病情急转直下，进展极快。
(8)庚型肝炎是肝细胞癌的相关因素，但大多数情况下，肝癌的发生可能是乙肝或丙肝病毒与庚肝病毒的协同作用。
