在联合治疗丙肝中，是用长效干扰素α-2a或2b（由制造商决定）和利巴韦林共同治疗的。干扰素是注射的，通常是一周一次。利巴韦林是口服胶囊，每日两次饭后服。
治疗时间的长短是由你的丙肝基因型决定的。如果你是2或3基因型，治疗需六个月。然而如果在三个月后，hcv-rna没有降低100倍（定量pcr法），或者pcr反应没有呈阴性，治疗就不需要再进行了。因为如果在头三个月中，治疗未能令病毒显著下降的话，最终获得持续的病毒学应答的机会就很小了。
如果你是1、4、5或6基因型，治疗需要长达一年。同样，如果在三个月后，hcv-rna没有降低100倍（定量pcr法），或者pcr反应没有成阴性，可能治疗就不需要再进行了。如果治疗到半年，而pcr测试仍是呈阳性的话，就要中止治疗了，因为最终获得持续的病毒学应答的机会就很小了。然而证据显示，治疗有助于减少病毒对肝脏的伤害，目前正在进行长期疗效方面的研究。长期治疗的费用科研方面不会负责，病人需要自己想办法支付延长疗程的费用。
由于干扰素和利巴韦林的副作用，并不建议某些身体状况不佳的病人使用联合治疗。我们会根据每个病人不同的情况来进行治疗，而那些具有以下“明确的禁忌征状”的人们如要接受治疗，的确会有着发展成为严重问题的高风险：
· 自身免疫功能的紊乱（由自身抗体产生的组织炎症和破坏）如严重的关节炎或不可控制的甲状腺疾病
· 自身免疫性肝炎
· 不可控制的糖尿病
· 心脏病
· 呼吸疾病
· 贫血（血红蛋白低水平）
联合治疗所需费用是根据你的体重决定的（因为体重决定剂量）。以2003年的价格，一个人估计每月需要花费1600到2300美元。同一个医学指南所规定的治疗费用在各个州和地区都不相同。你的所在地政府可能会支付你所有费用，或者减少你的费用，具体根据你的经济情况来定。如果你有治疗保险公司（个人计划或工作集体计划）的话，它也可能会帮你支付不足部分。在接受治疗之前，你应该和你的医生以及血友病诊所共同商讨治疗的费用问题。
